Rice University, Andrew Barron et son groupe, le travail avec des laboratoires en Italie, l'Allemagne et la Grèce, ont identifié des molécules spécifiques qui pourraient bloquer le moyen par lequel le virus mortel se répand en lui retirant son aptitude à se lier avec d'autres protéines.
L'aide de simulations informatiques, les chercheurs ont testé plus de 100 fullerènes de carbone ou C60 ( "buckyball"), les dérivés initialement développé à la Rice à des fins autres pour voir si elles pouvaient être utilisées pour inhiber une souche du virus, le VIH-1 PR, en attachant eux-mêmes de sa poche de liaison.
"Il ya beaucoup de gens qui font ce genre de recherche, mais elle tend à être un groupe ou une société pharmaceutique en prenant un fusil de chasse - font une molécule et tenter notre chance, faisons alors une autre molécule et tenter notre chance, dit-Barron , Charles Rice W. Duncan-Welch Jr., professeur de chimie et professeur de science des matériaux. "C'est intéressant parce que nous tâchons de relever un important problème d'une manière très rationnelle».
Les groupes ont rapporté leurs résultats dans un document publié sur le Journal de l'American Chemical Society of Chemical Information and Modeling site Web la semaine dernière.
Leur méthode de modélisation des méthodes d'attaques contre le VIH mai ne pas être unique, mais leur collaboration est. Les groupes de recherche de cinq établissements - deux en Grèce, un en Allemagne, une en Italie et le groupe Barron's à Rice - se sont réunis par e-mail contacts et les conversations pendant plusieurs mois, chacun travaillant sur les aspects du problème. «Pas tous les groupes ont jamais rencontré en personne", a dit M. Barron. Le plus remarquable, dit-il, est que leurs recherches à ce jour a été entièrement capitalisés.
En utilisant des simulations afin de restreindre d'une collection de fullerènes à trouver les bons, est "le moins de temps à faible coût de procédure efficace, la conception rationnelle des médicaments», l'équipe a écrit.
"Il ya longtemps, les gens remarqué que C60 s'intègre parfaitement dans la poche hydrophobe dans le VIH, et elle a un effet d'inhibition», a dit M. Barron. "Ce n'est pas particulièrement forte, mais il ya potentiellement un effet contraignant très fort. Le problème, c'est que ce n'est pas l'unité parfaite». L'objectif était de trouver une molécule de fullerène dérivés existants qui pourraient être facilement modifiée pour devenir l'unité parfaite.
Rice s'est impliqué, dit-il, «parce que nous faisons les molécules et les autres gars avaient une bonne méthode pour les essais in silico de molécules. Ils nous ont approché et lui dit: 'Pensez-vous que nous pourrions utiliser certains de ceux-ci? Puis nous avons commencé à rebondir idées autour.
"Nous avons commencé à penser à une expérience très simple de calculer l'efficacité de liaison d'une molécule dans la poche du VIH, puis de calculer que, pour une série de molécules, décider lequel convient le mieux, faites cette molécule dans la vie réelle et voir si elle est corrélée», a dit M. Barron. "Si c'est le cas, alors vous avez une façon de concevoir votre molécule finale. Notre travail a été la première étape dans le processus."
En effet, par leur «in silico», ou sur ordinateur, des calculs, ils ont trouvé deux s'intègre bien parmi les dérivés de fullerène testé et qui travaillent maintenant pour renforcer leurs propriétés de liaison pour obtenir cette molécule parfaite, celle qui colle »comme du Velcro" au virus et peuvent être affinés pour les souches différentes.
"Ce n'est qu'un élément du problème - on ne va pas à guérir le VIH», Barron a mis en garde. L'espoir, dit-il, est de développer une méthode pour la création rapide de médicaments pour traiter diverses souches de VIH et autres maladies.
Auteurs du document avec Barron étaient Manthos Papadopoulos de la Fondation nationale hellénique de la Recherche, Athènes; Serdar Durdagi de la Fondation nationale hellénique de la Recherche et de la Freie Universität, Berlin; Claudiu SUPURAN de l'Université de Florence, Italie; Amanda T. Strom, Nadjmeh Doostdar et Mananjali Kumar, de riz, et Thomas Mavromoustakos de la Fondation nationale hellénique de la Recherche et de l'Université d'Athènes.
Le caractère impromptu du projet intrigué Barron autant que le sujet lui-même. «Ici, vous avez des gens de calcul, les gens d'expérimentation, les gens de synthèse, la caractérisation des gens qui sont venus ensemble naturellement comme une collaboration et développé ce protocole, développé leurs propres méthodes.
"Et personne ne nous a payés de collaborer de bourses d'études supérieures. Serdar Durdagi a été financé par l'Union européenne. Les bourses d'étudiants diplômés Rice Amanda Strom, Nadjmeh Doostdar et Mananjali Kumar ont été financées, en partie, par le Centre du riz pour l'environnement biologique et les nanotechnologies. Ce est purement une collaboration universitaire ». Selon lui, le groupe travaille sur un deuxième document et rechercher un financement pour élargir le projet.
Source: AZoM.com
